Computação Química de Alto Impacto

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Drug Design ComputacionalVol. 8, N. 3 · 2024

Predição de Afinidade de Ligação via Redes Neurais de Grafos em Alvos Proteicos da Doença de Alzheimer

Apresentamos um framework baseado em Graph Neural Networks (GNN) para predição de afinidade de ligação proteína-ligante em alvos terapêuticos associados à doença de Alzheimer. O modelo foi treinado em 48.000 complexos cristalográficos do PDB e validado prospectivamente em ensaios de inibição enzimática, atingindo RMSE de 0.82 kcal/mol — desempenho superior a métodos de docking clássico em 34% dos casos testados.

R. Cavalcante, M. Tanaka, P. Ferreira, L. Okonkwo
DOI: 10.1234/cc.2024.08.0312 · pp. 214–231
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A. Mendes, C. Rodrigues, T. Hashimoto

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Molecular Dynamics2024

Simulações de Dinâmica Molecular Aumentada para Conformações de Proteínas Intrínsecamente Desordenadas

F. Oliveira, S. Nakamura, B. Adeyemi

DOI: 10.1234/cc.2024.07.0261Ler
Quantum Chemistry2024

Implementação de CCSD(T)-F12 para Energias de Dissociação em Complexos de Transferência de Carga

G. Santos, K. Watanabe, D. Müller

DOI: 10.1234/cc.2024.07.0248Ler

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